Espacios y ecosistemas costeros confieren al municipio de un elevado valor natural geológico y ecológico, además de paisajístico. Las "sierras planas" han dado lugar, al emerger, a fuertes escarpes, como el del acantilado de la sierra de Jerra en Prellezo, que se combinan, para dibujar un litoral muy recortado, con playas (Amió, Aramal y Pedrero en Pechón), puntas (punta de la Vigía) y las extraordinarias rías de Tina Mayor y Tina Menor con sus marismas. Asociadas a la caliza, aparecen una gran variedad de formas de disolución (lapiaces, dolinas...) entre las que destacan las conocidas cuevas del Rejo y Las Cabras en Luey, e importantes superficies de encinar cerca de esta población, en Abanillas y sobre todo en Pechón, que cuenta con uno de los encinares mejor conservados de Cantabria. La presencia de rodales de abedul en Pesués y los sauces de la ribera del Deva en las proximidades de Unquera, completan someramente un rico tapiz vegetal.