Cabezón de la Sal tiene un paisaje caracterizado por la llanura fluvial (vega) del río Saja, con bosque de ribera de alisos y sauces, además de choperas con algunos ejemplares parasitados por muérdagos. Las praderías dominan en la amplitud de la vega, con cierta repoblación de eucalipto en la cara norte del monte Aa, donde también pueden verse setas de fresnos.

Los parques de Cabezón y Carrejo tienen interesantes especies arbóreas, como las secuoyas gigantes, los carpes o los cornejos del Himalaya. Entre los arboles singulares destacan las secuoyas de Ygareda, ubicadas en Cabezón de la Sal; el tejo de Periedo, situado junto a la iglesia , con un tronco que mide unos 4m de circunferencia y el arbolado del Ferial, en Cabezón de la Sal, así como dos notables ejemplares de Sequoiadendron, en la finca del Centro Cultural Matilde de la Torre.

En cuanto a la fauna, el colirrojo real, que es un pájaro escaso, puede verse por los parques del municipio. También se contemplan ejemplares de cormoranes grandes sobre los chopos del Saja, en cuyas aguas no es dificil observar ánades.