Aunque el patrimonio del municipio destaca fundamentalmente en su arquitectura civil, también cuenta con interesantes iglesias y ermitas. La iglesia de San Lorenzo, ubicada en Casar de Periedo, es la más antigua, pues data del siglo XVI, aunque fue ampliada en XVII. En ella reposan los restos del violinista lebaniego Jesús de Monasterio.
La iglesia parroquial de Santa Eulalia, en Bustablado, fue construida a principios del siglo XVII. Otras dos iglesias que sobresalen son la de San Pedro, en Santibáñez que del siglo XVII, se encuentra dentro del clasicismo barroco y la de San Bartolomé, en Ontoria.

El patrimonio civil de Cabezón de la Sal se define principalmente por sus casonas blasonadas, como el palacio de la Bodega de finales del siglo XVIII. También se encuentran palacetes de influencia francesa e inglesa de finales del siglo XIX, como el de los condes de San Diego (Casa de Cultura) o el del doctor Arines (sede del Centro de Estudios Rurales del Universidad de Cantabria).